1. 无Ct值或出现太晚?
原因分析:模板浓度过低;模板降解;扩增效率低;模板纯度质低,蛋白质、盐等杂质会影响PCR扩增和荧光检测;引物扩增效率低; 目的基因表达量低;反应循环数不够;qPCR 体系污染;探针设计不合理。
解决方案:建议适当增加模板用量;检查模板是否降解,使用新鲜制备的模板;优化反应条件,尝试三步法反应程序;重新制备高质量的模板或对模板进行稀释,降低杂质浓度;重新设计高质量引物;提高模板中目的基因含量,如使用特异性引物进行反转录;循环数一般为40;使用干净耗材,反应体系在超净台内进行配制;优化探针序列、长度及退火温度。
2. 实验重复性差?
原因分析:引物特异性低而导致错配;模板浓度过低;仪器误差;实验耗材质量差;qPCR 体系污染。
解决方案:建议重新设计引物;减少模板稀释倍数;选择适用仪器,定期校准仪器;选用质量好的耗材;使用干净耗材,反应体系在超净台内进行配制。